Eesti Teadusfondi peamiseks rahastamisinstrumendiks on grandid – individuaaltoetus üksikteadlastele või teadlaste gruppidele eelkõige uute teadusideede aprobeerimiseks, otsingulisteks uurimistöödeks; teadlaste järelkasvu ning magistrantide ja doktorantide uurimistöösse kaasamise toetamiseks ja teadlaste rahvusvahelise koostöö arendamiseks. Tavagrantide konkursiga üheaegselt toimub noorteadlastele suunatud Minu esimese grandi konkurss ja seda juba aastast 2002.
Järeldoktorite teadustöö rahastamine toimub mitme programmi raames nagu riiklik järeldoktorite programm (2005-2010), teadlasmobiilsuse programm Mobilitas (2008-2015) ning programm ERMOS (2010-2014). Mobilitast rahastatakse Euroopa Sotsiaalfondist ning ERMOSt kaasrahastab Euroopa Liit COFUND skeemi raames.
Teadusfond rahastab Mobilitas programmi raames ka tippteadlasi, kes tulevad välismaalt tööle Eesti teadus- ja arendusasutusse, et luua siin oma uurimisgrupp ühes TA&I strateegia eelisarendatavatest valdkondadest.
Rahvusvahelise koostöö projekte rahastab teadusfond kas bilateraalsete (PARROT programm Prantsusmaaga, memorandumid Venemaa Humanitaarteaduste Fondi ja USA Civilian Research and Development Foundationiga) või üle-euroopaliste initsiatiivide (EUROCORES, ERA-NET, ARTEMIS, EMBO) raames. |